Genetic Diversity of Mountain Crabs (Potamidae) in Northeastern Thailand

Abstract

The aims of this study were to identify mountain crabs in family Potamidae using external morphology and genetic analysis. One hundred and one crabs were collected from 11 locations of 9 provinces n Northeastern, Thailand. According to external morphology study using first gonopod analysis found 6 species including S. somchaii, S. ubon, S. sakon, E. yotdomense, Potamon sp. and In. bhumibol. For the genetic study, DNA of each crab was extracted from chelae tissue and then amplified by the PCR technique using 16S rDNA and COI genes. The PCR products were analyzed for the nucleotide sequences and constructed phylogenetic tree using Maximum Likelihood (ML). Genetic analysis showed 4 clades, clade A: S. ubon, S. somchaii and S. sakon, clade B: Potamon sp., clade C: E. yotdomense and clade D: In. bhumibol. Nucleotide sequences of 5 mountain crabs are S. ubon, S. Somchaii , S. sakon, In. bhumibol and Potamon sp. were the new reported.

งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาการจัดจำแนกชนิดปูภูเขาวงศ์ Potamidae ในภาคตะวันออกเฉียงเหนือของประเทศไทย โดยใช้ลักษณะสัณฐานวิทยาภายนอก และศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมปูภูเขา โดยเก็บตัวอย่างจาก 11 พื้นที่ 9 จังหวัด ได้ทั้งหมด 101 ตัวอย่าง นำตัวอย่างที่ได้มาศึกษาลักษณะทางสัณฐานวิทยาภายนอกโดยใช้อวัยวะสืบพันธุ์เพศผู้คู่ที่ 1สามารถจัดจำแนกได้ทั้งหมด 6 ชนิด ได้แก่ S. somchaii, S. ubon, S. sakon, E. yotdomense, Potamon sp. และ In. bhumibol การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมโดยสกัดดีเอ็นเอจากเนื้อเยื่อก้ามปู และเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอด้วยเทคนิค PCR โดยใช้ยีน 16S rDNA และ COI จากนั้นนำไปวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ แล้วสร้างแผนภูมิความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมด้วยวิธี Maximum Likelihood (ML) พบว่ายีน 16S rDNA สามารถแบ่งได้ 4 เคลด (clade) ได้แก่ เคลด A ประกอบด้วย S. ubon, S. Somchaii และ S. sakonเคลด B คือ Potamon sp. เคลด C คือ E. yotdomense และ เคลด D คือ In. bhumibol การศึกษานี้เป็นรายงานครั้งแรกเกี่ยวกับการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ของปูภูเขาทั้ง 5 ชนิด คือ S. ubon, S. Somchaii , S. sakon, In. bhumibol และ Potamon sp.